{{$NEXT}} <<このエリアにspace or tabを挟んで追記する>>
とのこと (https://github.com/tokuhirom/Minilla/blob/master/lib/Minilla/Release/CheckChanges.pm#L20)
なので、
0.01 - Comments
という体裁にしたかったら、
{{$NEXT}} - Comments
と書くだけでよかった。
ref:
Not detecting version in Changes file · Issue #59 · tokuhirom/Minilla · GitHub
MinillaでNo mention of version '0.02' in changelog file 'Changes' - 鈍足ランナーのIT日記